В конце XIX века в Чойском районе проходил торговый путь, связывавший черневую тайгу с внешним миром, а зимний тракт вдоль реки Иша вёл купцов до Бийска.
До 1917 года территория входила в Томскую губернию (Бийский уезд). 1 июля 1917 года была образована Алтайская губерния с центром в Барнауле. В 1922 году в её составе появилась Ойротская автономная область, куда вошли Паспаульская, Успенская и Ыныргинская волости.
4 мая 1923 года волости укрупнили: на территории района образовали Успенскую волость, объединившую три прежние. В 1924 году её переименовали в Успенский аймак. В 1933 году аймак стал Чойским.
В 1956 года Чойский аймак упразднили, передав территорию Майминскому аймаку. 20 октября 1980 года район восстановили в прежних границах — с этого момента началась его новая история.
Фото: Госархив РА